科学家和DeepChem

科学圈子在很多方面都非常传统。 比如,导师和学生是一种学徒制的关系,一个导师通常带少量的学生。

这个模式已经存在了多个世纪,并且可以帮助新生学习高级科学家的思维方式。

具体来说,当今大多数科学研究都是在以这种传统方式在实验室中进行的。 首席研究员负责运营整个实验室,和本科生、研究生、以及博士一起进行科学研究并发表论文。

实验室运营费用是由基金资助的,基金通常来自政府和慈善机构。 论文和引用是该系统的关键货币,拥有强大的论文发表记录对于任何科学家来说都是必须的。

由于多种原因,在这种模式下很难开发出高质量的软件。 第一,学生在实验室中呆的时间有限(通常为3-5年)。 这意味着高流动性,当学生毕业离开的时候,关键知识可能会丢失。

第二,对软件资助的资金比较少,很难获得。 实验室可能选择专注于科学发现而不是必要的软件工程。 (虽然, 值得注意的是,有许多例外情况!比如DeepChem等其他高质量的软件目诞生于学术实验室 项目。)

我们相信,对DeepChem的贡献和使用对科学职业非常有帮助。 DeepChem可以长期帮助维护新的科学算法,确保学生毕业后继续使用您的代码继续被使用。

我们已经看到太多精彩的项目在学生毕业后陷入困境, 而我们可以助您确保你的算法具有最大的影响力。

让你的学生把你的算法贡献到DeepChem项目中,这样后续DeepChem开发人员会帮忙维护。

科学家常见问题

使用自己的软件包而不是使用DeepChem,对我的职业生涯会更好吗?

答案确实取决于您在职业生涯的目标! 编写和维护好的软件非常难。 这个需要仔细测试并持续维护和改进。否则,随着时间的流逝,您的代码将变得毫无用处。 如果您专注于新发明,并且发现软件工程的吸引力不强, 那么与DeepChem一起工作,可能会让您专注于新的算法,并利用DeepChem项目的基础架构来 维护您的发明,从而加速您的职业发展。 此外,您可能会从参与DeepChem社区活动中获得很多启发。 看看其他科学家如何解决问题,并与世界各地的合作者建立联系可以帮助您以新的方式看待问题。 长期的DeepChem贡献者发现,他们经常在一起写论文! 综上所述,在必要的时候可以建立你自己的项目。 尤其是当你想探索的想法在DeepChem中并没有实现或者很难实现的时候,你需要自己编写相应的代码, 当然我们也非常乐意和你一起合作。 DeepChem 依赖于大量的科学软件包,我们也非常乐意让你的软件包被我们的用户使用。

是否有 DeepChem 首席研究员?

尽管DeepChem诞生于斯坦福大学的Pande 实验室, 但是现在该项目以去中心研究组织的形式存在。 更准确的说,有多个非正式的”DeepChem PIs”, 只要你在工作中使用DeepChem,你就是一个DeepChem PI!

我是否需要将DeepChem团队成员添加为论文的共同作者?

我们的建议按照通常的科学评价标准决定是否添加DeepChem团队成员添加为论文的共同作者。 如果某个 DeepChem 团队成员为您的努力做出了巨大贡献, 添加他们作为论文共同作者可能有意义。 如果DeepChem团队人员没有直接对你的工作做出足够大的贡献, 那么只需要致谢或者应用DeepChem就可以了!

我想在DeepChem中实现我特定的科研想法。 作为DeepChem贡献者,我怎样才能不让我的贡献在噪音中丢失吗? ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^

对于新科学家来说,在职业生涯的初期建立自己的科研方向和科学贡献非常重要。 我们认为DeepChem可以帮到你。 如果你为DeepChem增加了重要的新功能,这时以第一作者或者通讯作者写一篇论文介绍DeepChem的新功能以及你的贡献将会非常有意义。 作为一个去中心的组织,我们非常乐意帮助你开启你的职业生涯。

我是一位有抱负的科学家,但不是实验室的成员。 我可以加入DeepChem吗?

当然! DeepChem的核心任务是使深度学习在科学领域的使用更加方便和自由。 这意味着没有障碍,没有壁垒。 欢迎任何人加入并做出贡献。 加入我们的开发人员电话,与我们的科学家一对一聊天, 他们中的许多人很高兴与新生一起工作。 您可以建立联系 帮助您加入传统的实验室,或者您可以选择形成自己的独立科研道路。 不管怎样,我们很高兴为您提供支持。

DeepChem有基金支持吗

目前环没有,但我们正积极寻找基金以支持DeepChem的研究人员。 如果您是PI,想要和我们合作请与我们联系!

我是工业界的研究员,我可以加入吗?

当然可以,DeepChem最强大的特点是它的社区。 成为DeepChem的一员,可以更好的帮助你拓展你的职业朋友圈和提高你的技能。 在公司终身工作越来越不常见。 加入我们的社区将让你建立跨工作的纽带,并可以帮助你更好的完成你现在的工作。

知识产权怎么归属?

DeepChem的核心目标之一是构建一套共享的不被专利锁定的科学资源和技术。 我们希望使您的公司或组织能够放心的使用DeepChem技术,而不需要对专利侵权的担心。 作为回报,我们希望您作为一个负责任的社区成员,并投入尽可能多的贡献。 如果您发现 DeepChem 非常有价值,请考虑贡献一些创新或改进,以便其他人能够从中受益。 如果你的发明获得了专利,尽量确保你没有DeepChem中的任何东西。 很多事情都偷偷溜过了专利审查。 作为一个开源社区,我们没有资源积极保护自己,我们依靠你的判断和帮助!

如果我在内部数据上使用DeepChem,是否需要发布数据?

不需要! DeepChem 采用的是 MIT 许可协议. 您利用DeepChem进行的任何分析都完全属于您。您没有义务发布您的专有数据或发明。

如果我要发布数据怎么办? DeepChem可以提供帮助吗?

如果你想开源一部分数据,DeepChem项目中维护了一套开源数据集合[MoleculeNet](https://deepchem.readthedocs.io/en/latest/moleculenet.html),可以把你的数据加入到这个集合中。 将您的数据集添加到MoleculeNet数据集和,可以使得大量用户可以方便地访问您发布的数据。 请务必注意,MoleculeNet提供了对数据的编程访问,这可能不适用于所有类型的数据(可能受法规/法律约束的数据 如临床或患者的信息)。 开源数据集非常有意义,但需要谨慎处理。

MoleculeNet数据集都是关于分子的吗?

我们欢迎加入非分子数据集加入到MoleculeNet中。

MoleculeNet是否允许以不同的许可证发布数据?

MoleculeNet已经支持在不同的数据集使用不同的许可协议。 我们可以与您合作,使用您的数据集由你决定使用哪一个许可协议。